MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanothermococcus okinawensis IH1 plasmid pMETOK01

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015632	AATG	2	8	7	14	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015632	ATA	3	9	1335	1343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015632	ATA	2	6	1351	1356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015632	T	6	6	1367	1372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015632	TAG	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015632	A	6	6	1453	1458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015632	CTC	2	6	1538	1543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015632	AT	3	6	1562	1567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015632	ATC	2	6	1581	1586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015632	ATTTAA	2	12	1601	1612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015632	T	7	7	1620	1626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015632	TAT	2	6	1660	1665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015632	T	7	7	1665	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015632	CAA	2	6	1688	1693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015632	T	6	6	1695	1700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015632	TA	3	6	1740	1745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015632	TA	3	6	1783	1788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015632	A	8	8	1803	1810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015632	ACA	2	6	1832	1837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015632	TAA	3	9	1844	1852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015632	ATA	2	6	1874	1879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015632	AAT	2	6	1933	1938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015632	ACT	2	6	1950	1955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015632	AT	3	6	1968	1973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015632	A	8	8	1978	1985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015632	TA	3	6	2012	2017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015632	A	7	7	2025	2031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015632	TAA	3	9	2034	2042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015632	A	8	8	2047	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015632	A	6	6	2059	2064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015632	TTAA	2	8	2065	2072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015632	ATAA	2	8	2125	2132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015632	A	6	6	2134	2139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015632	AATA	2	8	2153	2160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015632	TAA	2	6	2171	2176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015632	TA	3	6	2191	2196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015632	TATAT	2	10	2227	2236	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015632	A	8	8	2259	2266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015632	TA	3	6	2314	2319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015632	A	7	7	2343	2349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015632	A	7	7	2376	2382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015632	TA	3	6	2417	2422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015632	AAT	2	6	2426	2431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015632	AT	3	6	2471	2476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015632	TTTAT	2	10	2480	2489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015632	AC	3	6	2525	2530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015632	AT	3	6	2535	2540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015632	AC	3	6	2551	2556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015632	TGTA	2	8	2559	2566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015632	ATTA	2	8	2567	2574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015632	ATTA	2	8	2594	2601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015632	AAC	2	6	2602	2607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015632	AT	3	6	2632	2637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015632	TTAT	2	8	5049	5056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015632	TA	3	6	5094	5099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015632	TAC	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015632	AT	3	6	8605	8610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015632	AAT	2	6	8611	8616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015632	T	7	7	8627	8633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015632	T	6	6	8636	8641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015632	TA	3	6	8724	8729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015632	TA	4	8	8731	8738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015632	TAGA	2	8	8747	8754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015632	ATAA	2	8	8761	8768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015632	TTA	2	6	8829	8834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015632	TTC	2	6	9329	9334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015632	AT	3	6	9360	9365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015632	TGTA	2	8	9369	9376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015632	ATGG	2	8	9427	9434	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015632	TCTAAT	2	12	9485	9496	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015632	ATA	2	6	9529	9534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015632	TA	3	6	9533	9538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015632	AT	3	6	9554	9559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015632	A	7	7	12672	12678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015632	ACC	2	6	13224	13229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015632	TAT	2	6	13240	13245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015632	ATATT	2	10	13261	13270	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015632	AAAT	2	8	13312	13319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015632	ATA	2	6	13329	13334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015632	TA	3	6	13351	13356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015632	GTATA	2	10	13358	13367	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015632	A	7	7	13438	13444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015632	ATTT	2	8	13451	13458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015632	ATT	2	6	14036	14041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015632	TAT	2	6	14054	14059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015632	ATA	2	6	14062	14067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015632	A	6	6	14137	14142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015632	TAT	2	6	14638	14643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015632	TA	3	6	14721	14726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015632	TA	3	6	14749	14754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015632	ATA	3	9	14752	14760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015632	TA	3	6	14759	14764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015632	ATT	2	6	14792	14797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015632	AAT	2	6	14886	14891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.